Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms