Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms