Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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