Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIDRQ14159 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms