Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF1Q13972 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms