Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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