Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMB3Q13751 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMB3Q13751 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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