Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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