Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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