Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NAE1Q13564 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NAE1Q13564 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NAE1Q13564 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NAE1Q13564 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NAE1Q13564 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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