Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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CALCOCO2Q13137 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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