Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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