Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms