Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F3Q08477 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms