Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms