Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FMODQ06828 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FMODQ06828 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms