Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms