Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms