Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms