Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms