Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms