Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB2Q00722 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms