Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms