Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBA52P62987 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBA52P62987 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBA52P62987 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBA52P62987 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms