Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms