Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2A1P52655 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms