Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A6P48664 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms