Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTRNP46939 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms