Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR4A2P43354 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms