Protein–RNA interactions for Protein: P41595

HTR2B, 5-hydroxytryptamine receptor 2B, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2BP41595 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2BP41595 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms