Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC27P30260 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC27P30260 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC27P30260 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC27P30260 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms