Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms