Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms