Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms