Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN3P20807 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms