Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms