Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PVALBP20472 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PVALBP20472 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms