Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSP20132 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSP20132 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDSP20132 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDSP20132 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms