Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms