Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms