Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms