Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms