Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA1P05813 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA1P05813 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA1P05813 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA1P05813 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA1P05813 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA1P05813 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA1P05813 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms