Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC3P02656 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC3P02656 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms