Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM2O94769 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms