Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms