Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms