Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms