Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUSD5O60279 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms