Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms